Libros
* Fernández-Eguiarte A., C. I. Castelán-Hernández, Á. V. Bautista-Durán, R. I. Trejo-Vázquez, J. Zavala-Hidalgo y R. Romero-Centeno. Bioclima, cambio climático y ecosistemas en el estado de Tabasco y áreas adyacentes, México (Bases de datos, metadatos y visualizaciones cartográficas).
* Fernández-Eguiarte A., R. Romero-Centeno, J. Zavala-Hidalgo, B. Kucienska: Atlas Climático de México y Áreas Adyacentes. Vol. 2. Centro de Ciencias de la Atmósfera, UNAM. Servicio Meteorológico Nacional. Comisión Nacional del Agua. ISBN: en trámite. 1a edición, 969 pp. Libro electrónico (http://atlasclimatico.unam.mx/ACM_vol2), (2013).PDF
* Fernández-Eguiarte A., R. Romero-Centeno, J. Zavala-Hidalgo: Atlas Climático de México y Áreas Adyacentes. Vol. 1. Centro de Ciencias de la Atmósfera, UNAM. Servicio Meteorológico Nacional. Comisión Nacional del Agua. ISBN: 978-607-02-3314-2. 1a edición, 204 pp. Libro electrónico (http://atlasclimatico.unam.mx/ACM), (2012).PDF
* Fernández-Eguiarte A., R. Romero-Centeno, J. Zavala-Hidalgo, I. Trejo-Vázquez, C. Conde-Álvarez: Atlas Climático y de Cambio Climático del Estado de Oaxaca, México. Centro de Ciencias de la Atmósfera, UNAM. ISBN: 978-607-02-3295-4. 1a edición, 220 pp. Libro electrónico (http://atlasclimatico.unam.mx/oaxaca), (2012).PDF
* Barberán, J., C. Cárdenas, A. López Monjardín y J. Zavala: Radiografía del Fraude. Análisis de los datos oficiales del 6 de julio. Ed. Nuestro Tiempo, Noviembre, (1988).
* Zavala-Hidalgo, J.: Manual del Entrenador, Nivel 3 Tenis de Mesa, SICCED, Comisión Nacional del Deporte, México, pp 105, (2000).
Capítulos de libros
* Zavala-Hidalgo, J., J. L. Ochoa, et al.: Cambios en el nivel del mar. En: Reporte Mexicano de Cambio Climático, Volumen I Bases científicas, Modelos y modelación. Gay, C., Cos, A., Peña, C. T. (Eds.), PINCC-UNAM, ISBN 978-607- 02-7522- 7, 57-77, (2016).
* Ochoa, J. L., J. Zavala-Hidalgo et al.: Observaciones oceánicas. En: Reporte Mexicano de Cambio Climático, Volumen I Bases científicas, Modelos y modelación. Gay, C., Cos, A., Peña, C. T. (Eds.), PINCC-UNAM, ISBN 978-607- 02-7522- 7, 35-54, (2016).
* Ruiz-Angulo, A., & Zavala-Hidalgo, J. : Internal Wave Observations in the Petacalco Canyon, México. In Recent Advances in Fluid Dynamics with Environmental Applications (pp.203-213). Springer International Publishing.,(2016)
* Fernández-Eguiarte, A., R. Romero-Centeno, J. Zavala-Hidalgo: Bases de datos georreferenciadas en la Unidad de Informática para las Ciencias Atmosféricas y Ambientales (UNIATMOS) del Centro de Ciencias de la Atmósfera de la UNAM. En: Monitoreo de riesgo y desastre asociados a fenómenos hidrometeorológicos y cambio climático. Frausto Martínez, O. (Coord.-Ed.). Universidad de Quintana Roo, CONACYT, REDESClim, 24-34, 90 pp. ISBN 978-607- 9015-62- 6. (2014).
* Zavala-Hidalgo, J., R. de Buen Kalman, R. Romero-Centeno, F. Hernández Maguey: Tendencias del nivel del mar en las costas mexicanas. En: A.V. Botello, S. Villanueva-Fragoso, J. Gutiérrez y J. L. Rojas Galaviz (eds.), Vulnerabilidad de las zonas costeras mexicanas ante el cambio climático. SyG Editores. Gobierno del Estado de Tabasco. Semarnat-INE, UNAM-ICMyL, Universidad Autónoma de Campeche, pp. 249-267, 514 p. ISBN 978-607-7887-11-9 (v. impresa). ISBN 978-607-7887-12-6 (v. electrónica), (2010).
* Zavala Hidalgo, J. , R. Romero Centeno, E. Galvanovskis, Ma. de la Luz Lagunas y Ma. Elena Osorio Tai. Informe final: Reconstrucción de la concentración de petróleo proveniente del derrame ocasionado por el accidente de la plataforma de British Petroleum en el Golfo de México ocurrido en 2010. Instituto Nacional de Ecología-SEMARNAT, 35 pp. Mayo (2012).
* Gallegos-García, A., Zavala-Hidalgo, J., Zavala-Romero, O., Lecuanda, R., Mateos-Jasso, A. y Rodríguez-Sobreyra, R.: Imágenes dinámicas de la temperatura de la superficie de los mares de México, 1996-2003. En: Ordenamiento ecológico marino. Visión integrada de la regionalización. Compiladores Ana Córdova y Vázquez, Fernando Rosete Vergés, Gilberto Enríquez Hernández, Benigno Hernández de la Torre. Instituto Nacional de Ecología (SEMARNAT), México, 43-72, 232 p., (2009).
* Escobar, E., M. Maass: Diversidad de procesos funcionales en los ecosistemas. Coautores: J. Alcocer Durand, E. Azpra Romero, L. I. Falcón Álvarez, A. Gallegos García, F. J. García, F. García-Oliva, V. Jaramillo, R. Lecuanda Camacho, V. Magaña, A. Martínez-Yrízar, A. Muhlia, R. Rodríguez Sobreyra, J. Zavala-Hidalgo. En: Capital natural de México, Vol. I: Conocimiento actual de la biodiversidad. CONABIO, México. pp. 161-189, (2008).
* Fernández Eguiarte, A. y J. Zavala Hidalgo: Modelo Digital de Elevación de la República Mexicana y Zonas Adyacentes. En: Nuevo Atlas Nacional de México, Coord. Dra. Atlántida Coll-Hurtado, Instituto de Geografía, UNAM, (2007).
* Zavala Hidalgo J. y A. Fernández Eguiarte: Propuesta para la regionalización de los mares mexicanos desde el punto de vista de los procesos físicos: el caso del Golfo de México. En: Ordenamiento ecológico marino. Visión temática de la regionalización. Ana Córdova y Vázquez, Fernando Rosete Verges, Gilberto Enríquez Hernández y Benigno Fernández (compiladores), SEMARNAT-INE, ISBN 968-817-807-1, (2007).
* Gallegos García, A., J. Zavala Hidalgo y R. Lecuanda: Huellas térmicas sobre la superficie oceánica resultado de procesos físicos a escala regional y local detectados con radiómetros satelitales AVHRR. Algunos ejemplos en el Pacífico Mexicano. En: Ordenamiento ecológico marino. Visión temática de la regionalización. Ana Córdova y Vázquez, Fernando Rosete Verges, Gilberto Enríquez Hernández y Benigno Fernández (compiladores), SEMARNAT-INE, ISBN 968-817-807-1, (2007).
* Gallegos García, A., R. Rodríguez S., E. Márquez, R. Lecuanda y J. Zavala-Hidalgo: Una climatología de la temperatura de la superficie del mar de las aguas adyacentes a las costas de Jalisco, Colima y Michoacán, México: 1996-2003. En: Los recursos marinos y acuícolas de Jalisco, Colima y Michoacán. Instituto Nacional de la Pesca, Ma. del Carmen Jiménez Quiroz, Elaine Espino Barr (Editoras), SAGARPA, ISBN 968800-695-5, (2007).
* Morey, S.L., J. Zavala-Hidalgo and J.J. O’Brien: The seasonal variability of continental shelf circulation in the northern and western Gulf of Mexico from a high-resolution numerical model. En: Circulation in the Gulf of Mexico, Observations and Models. W. Sturges and A. Lugo-Fernandez Eds., Geophysical Monograph Series 161, American Geophysical Union, Washington, D. C., 10.1029/161GM01, 2005. (Con arbitraje de pares).
* Sheinbaum, J., J. Zavala y J. Candela: Modelación numérica del Golfo de México y Mar Caribe. En: Contribuciones a la Oceanografía Física en México (Capítulo 12), Monografía No. 3, Unión Geofísica Mexicana. M. F. Lavín, Ed., 243-264, 1997.
* Zavala, J., A. Parés-Sierra, J. Ochoa and J. Sheinbaum: A numerical study of the circulation and sea surface temperature of the Gulf of Mexico. En: Numerical Simulations in the Environmental and Earth Sciences, Proceedings of the Second UNAM-CRAY Supercomputing Conference, Cambridge University Press, 49-57, 1997. (Con arbitraje de pares).
* Scenario Modeling of Climate Change on the Ocean Circulation of the Intra-Americas Sea, A. Gallegos, S. Czitrom, J. Zavala and A. Fernández. En: Climate Change in the Intra-Americas Sea, George Maul (Ed.), United Nations Caribbean Program (UNCP) - Intergovernmental Oceanographic Commission (IOC). Edward Arnold, ISBN 0-340-58981-7, 55-74, 1993. (Con arbitraje de pares).